Die Abteilung für medizinische Gutachten erstellt ambulante Expertengutachten im Auftrag von Kantons- und Regionalbehörden. 

Diese Gutachten können beispielsweise bei einem Verdacht der Fahruntauglichkeit, z.B. infolge von Alkohol-, Drogen- oder Medikamentenkonsum, mit dem Ziel erstellt werden, die Fahreignung abzuklären.

Darüber hinaus kann die Abteilung verschiedene Arten von forensisch-psychiatrischen Gutachten erstellen. Diese befassen sich einerseits mit zivilrechtlichen Aspekten, zum Beispiel der Frage nach der Urteilsfähigkeit von Personen im Hinblick auf die Zusprache einer Beistandschaft oder des Sorgerechts. Andererseits können sie strafrechtliche Aspekte betreffen wie etwa die Frage nach der Schuldfähigkeit, können aber auch Rückfallprognosen oder eine Einschätzung des Gefahrenpotenzials bestimmter Personen enthalten.

Darüber hinaus kann die Abteilung von der IV beauftragt werden, Gutachten zur Arbeitsfähigkeit von erkrankten oder verunfallten Personen zu erstellen.